人脑脊液的代谢组学研究标识恶性神经胶质

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脑疾病病人的脑脊液(CSF)通常用来诊断和监测研究,但是恶性胶质瘤病人脑脊液组成的变化很少被人们所知。该研究作者建立了靶向代谢组学分析方法,采用SRM监测模式,使用正负离子切换的方法在CSF中鉴定到了种极性代谢物。样品来源于10例胶质瘤病人与7例对照。百趣代谢组学文献分享,采用多种统计手段对数据进行分析,为神经性疾病生物标志物的发现提供参考。

10位胶质瘤病人包含4例新诊断的胶质瘤病人及6例复发病人。7例对照未诊断出任何胶质瘤。除了3号病人通过脑室采集CSF外,其余均通过腰椎穿刺采集。样品采自27-67岁的男性和女性患者,样品保存于-80℃冰箱直至测定。百趣代谢组学文献分享,同时测定了一些临床指标如白细胞计数、血清总蛋白水平、血糖水平、LDH水平等(见表1)。测定的肿瘤指标包括肿瘤进程、生存期、肿瘤大小等。

对于CSF的前处理,作者向μL脑脊液样品中加入80%甲醇,-20℃下沉淀蛋白过夜。之后在4℃下rpm离心10min。取上清液吹干,用50μL水-乙腈(95:5)复溶。rpm离心5min,取上清液吹干,保存于-80℃冰箱。样品用20μL水(质谱级)复溶,取10μL进液质分析。

表1胶质瘤病人的基本信息及临床参数

靶向分析的LC-MS/MS条件如下:采用QTRAP(AB/SCIEX)和UFLC(岛津)分析系统。质谱共设定了个SRM离子对,并采用正负离子切换的模式检测。百趣代谢组学文献分享,喷嘴电压(正离子模式):+V,喷嘴电压(负离子模式):-V;源温:℃;dwelltime:4ms;cycletime:1.89s;色谱柱采用LunaNH2HILIC(Phenomenx,Torrance,CA);流速:μL/min;流动相A:20mM氢氧化铵和20mM乙酸铵(pH=9.0)水溶液:乙腈(95:5),流动相B:乙腈;洗脱梯度:0-5min:85-40%B;5-16min:40-0%B;16-24min,0%B;24-25min,0-85%B;25-32min,85%B。

所有的统计计算使用CRAN软件完成(



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