健康脑组织对细菌有一定抗御能力，实验证明把致病菌接种于脑内，很难造成小脑脓肿。脑损伤、梗塞引起的脑组织坏死，以及术后残留死腔等则有利于小脑脓肿的形成。小脑脓肿大多继发于颅外感染，少数因开放性颅脑损伤或开颅术后感染所致。根据感染来源可分为：

（一）直接来自邻近感染灶的小脑脓肿其中以慢性化脓性中耳炎或乳突炎并发胆脂瘤引起者最常见，称小脑脓肿，约2／3发生于同侧颞叶，1/3在同侧小脑半球，大多为单发脓肿，但也可以是多房性的。额窦或筛窦炎可引起同侧额叶突面或底面的脓肿，称鼻源性小脑脓肿。蝶窦炎可引起鞍内或颞叶、脑干等脓肿。头皮疖痈、颅骨骨髓炎等也可直接蔓延至颅内形成小脑脓肿。这些脓肿大多发生在原发感染灶同侧。少数在对侧，此时小脑脓肿是通过血源性播散而形成。小脑脓肿的发生率一度占小脑脓肿的首位，近来随人民生活水平提高和对中耳炎防治的普及，其发生率已退居在血源性小脑脓肿之后。

（二）血源性小脑脓肿多因脓毒血症或远处感染灶经血行播散到脑内而形成。如原发感染灶为胸部化脓性疾患（如脓胸、肺脓肿、支气管扩张症等）称为肺源性小脑脓肿；因心脏疾患（细菌性心内膜炎、先天性心脏病等）引起者称为心源性小脑脓肿。此外，皮肤疖痈、骨髓炎、牙周脓肿、膈下脓肿、胆道感染、盆腔感染等均可成为感染源。此类脓肿常为多发，分布于大脑中动脉供应区，以额、顶叶多见，少数可发生于丘脑、垂体、脑干等部位。

（三）创伤性小脑脓肿在开放性颅脑损伤中，因异物或碎骨片进入颅内带入细菌，细菌也可从骨折裂缝侵入。非金属异物所致的小脑脓肿多发生在伤后早期，金属异物所致者，则多在晚期，有长达38年后发病的报告。脓肿部位多位于伤道或异物所在处。

（四）医源性小脑脓肿因颅脑手术感染所引起，如发生于开颅术、经蝶（或筛）窦手术、立体定向术后感染。

（五）隐源性小脑脓肿感染源不明，可能因原发病灶很轻微，已于短期内自愈或经抗生素等药物治愈，但细菌经血行已潜伏于脑内，一旦人体抵抗力减弱，潜伏的细菌就繁殖而致小脑脓肿。因此这类小脑脓肿多为血源性，其病原体毒力低或机体抵抗力较强，急性化脓性炎症期不显著，病程长，诊断常困难。